Новая программа находит родственные участки геномов разных животных
Международная группа ученых, в которую вошли представители Университета ИТМО, создала программный инструмент, который позволяет быстро и эффективно находить похожие участки в геномах разных животных. Это необходимо для того, чтобы понять, насколько два вида близки друг к другу и насколько далеко они отошли в ходе эволюции от общего предка.
На планете Земля обитают миллионы биологических видов – это огромное разнообразие заложено на генетическом уровне. Анатомия, размер, окрас, образ жизни животных определяются их генами. Между тем вариативность самих генов заметно меньше – их ученые насчитали более 20 тысяч. Получается, что два вида отличаются друг от друга не только набором генов, но и тем, как они расположены друг относительно друга. На языке сравнительной геномики это называется синтения, то есть порядок расположения генов и регуляторных элементов.
«Возьмем, к примеру, гориллу и шимпанзе, – рассказывает инженер-исследователь Университета ИТМО Ксения Крашенинникова,– эти два вида имеют одинаковый набор генов, но элементы их регуляции и перестройки генома создают немного разный порядок, что приводит к отличиям между этими приматами».