Фотоиндукция увеличила скорость CRISPR в 100 раз
Американские ученые синхронизировали работу системы CRISPR-Cas9 при помощи света. Фоточувствительная химическая модификация направляющей РНК позволила не только одновременно разрезать ДНК в популяции клеток, но и сделать это гораздо быстрее, чем обычно. Исследование опубликовано в Science, также в журнале вышла сопутствующая редакционная статья.
На эффективность редактирования генома при помощи CRISPR-Cas9 влияет множество факторов, и один их них — время образования молекулярных комплексов. На то, чтобы комплекс РНК-Cas9 распознал мишень, связался с ней и осуществил разрез, требуется время. В одних клетках это происходит быстрее, в других медленнее, или вообще не происходит. Следствием этого, в частности, может быть проблема мозаичности эмбрионов, в результате которой разные клетки будущего организма содержат разные варианты гена. Даже в одной и той же клетке разные копии гена на двух хромосомах могут разрезаться с разной скоростью и эффективностью. Чаще всего случается так, что одна копия гена уже порезалась и «зашилась», а до другой комплекс вообще не добрался. По этой причине редактирование диплоидных клеток представляет определенные затруднения.